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Crohn’s disease: review and standardization of nomenclature
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Magalhães, Filipe C. B.

; Lima, Elissandra Melo

; Carpentieri-Primo, Pedro

; Barreto, Miriam Menna

; Rodrigues, Rosana Souza

; Parente, Daniella Braz

Radiologia Brasileira

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Mar 2023, Volume 56 Nº 2 Páginas 95 - 101

Resumo: En Pt | Texto: En Pt | PDF: En | PDF: Pt

Abstract Crohn’s disease is an inflammatory bowel disease that can affect any segment of the gastrointestinal tract. It has a variable clinical course, with alternating periods of disease activity and remission. Because the incidence and prevalence of Crohn’s disease have been increasing, evaluation by imaging methods has become more important. The most widely used methods are computed tomography enterography, magnetic resonance enterography (as an elective examination), and contrast-enhanced computed tomography (in the context of emergency). Computed tomography enterography and magnetic resonance enterography are useful for diagnosis, follow-up, evaluation of complications, and prognosis. Both can be used in order to evaluate the small bowel loops and the associated mesenteric findings, as well as to evaluate other abdominal organs. They both also can detect signs of disease activity, fibrosis, penetrating disease, and complications. The interpretation of such changes is essential to the multidisciplinary approach, as is the standardization of the nomenclature employed in the reports. In this paper, we review and illustrate the imaging findings of Crohn’s disease, using the standardized nomenclature proposed in the multidisciplinary consensus statement issued by the Society of Abdominal Radiology, the Society of Pediatric Radiology, and the American Gastroenterology Association, with recommendations for descriptions, interpretations, and impressions related to those findings.

Resumo Doença de Crohn é uma doença inflamatória intestinal que pode acometer qualquer segmento do trato gastrointestinal, com curso clínico variado, alternando períodos de atividade de doença e remissão. Sua incidência e prevalência vêm aumentando, tornando a avaliação por métodos de imagem mais importante. Os métodos mais utilizados são enterotomografia computadorizada, enterorressonância magnética eletivamente e tomografia computadorizada com contraste no contexto da emergência. A enterotomografia computadorizada e a enterorressonância magnética são úteis para diagnóstico, seguimento, avaliação de complicações e para prognóstico. Avaliam as alças intestinais delgadas e os achados mesentéricos associados, além dos demais órgãos abdominais. Detectam sinais de atividade de doença, sinais de cronicidade e doença penetrante e complicações, importantes para a escolha do melhor tratamento. A interpretação dessas alterações é fundamental para que a equipe multidisciplinar trabalhe conjuntamente com compreensão da linguagem utilizada nos relatórios. Neste artigo, apresentamos uma revisão dos achados de imagem da doença de Crohn e ilustramos os possíveis achados dessa doença utilizando a nomenclatura padronizada proposta no consenso multidisciplinar composto pelas Sociedade de Radiologia Abdominal, Sociedade de Radiologia Pediátrica e a Associação Americana de Gastroenterologia, com recomendações de descrição, interpretação dos achados e recomendações de impressão.

https://doi.org/10.1590/0100-3984.2022.0082-en

Artificial intelligence to predict the need for mechanical ventilation in cases of severe COVID-19
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Godoy, Mariana Frizzo de

; Chatkin, José Miguel

; Rodrigues, Rosana Souza

; Forte, Gabriele Carra

; Marchiori, Edson

; Gavenski, Nathan

; Barros, Rodrigo Coelho

; Hochhegger, Bruno

Radiologia Brasileira

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Mar 2023, Volume 56 Nº 2 Páginas 81 - 85

Resumo: En Pt | Texto: En Pt | PDF: En | PDF: Pt

Abstract Objective: To determinate the accuracy of computed tomography (CT) imaging assessed by deep neural networks for predicting the need for mechanical ventilation (MV) in patients hospitalized with severe acute respiratory syndrome due to coronavirus disease 2019 (COVID-19). Materials and Methods: This was a retrospective cohort study carried out at two hospitals in Brazil. We included CT scans from patients who were hospitalized due to severe acute respiratory syndrome and had COVID-19 confirmed by reverse transcriptionpolymerase chain reaction (RT-PCR). The training set consisted of chest CT examinations from 823 patients with COVID-19, of whom 93 required MV during hospitalization. We developed an artificial intelligence (AI) model based on convolutional neural networks. The performance of the AI model was evaluated by calculating its accuracy, sensitivity, specificity, and area under the receiver operating characteristic (ROC) curve. Results: For predicting the need for MV, the AI model had a sensitivity of 0.417 and a specificity of 0.860. The corresponding area under the ROC curve for the test set was 0.68. Conclusion: The high specificity of our AI model makes it able to reliably predict which patients will and will not need invasive ventilation. That makes this approach ideal for identifying high-risk patients and predicting the minimum number of ventilators and critical care beds that will be required.

Resumo Objetivo: Determinar a acurácia da tomografia computadorizada (TC), avaliada por redes neurais profundas, na ventilação mecânica, de pacientes hospitalizados por síndrome respiratória aguda grave por COVID-19. Materiais e Métodos: Trata-se de estudo de coorte retrospectivo, realizado em dois hospitais brasileiros. Foram incluídas TCs de pacientes hospitalizados por síndrome respiratória aguda grave e COVID-19 confirmada por RT-PCR. O treinamento consistiu em TC de tórax de 823 pacientes com COVID-19, dos quais 93 foram submetidos a ventilação mecânica na hospitalização. Nós desenvolvemos um modelo de inteligência artificial baseado em redes de convoluções neurais. A avaliação do desempenho do uso da inteligência artificial foi baseada no cálculo de acurácia, sensibilidade, especificidade e área sob a curva ROC. Resultados: A sensibilidade do modelo foi de 0,417 e a especificidade foi de 0,860. A área sob a curva ROC para o conjunto de teste foi de 0,68. Conclusão: Criamos um modelo de aprendizado de máquina com elevada especificidade, capaz de prever de forma confiável pacientes que não precisarão de ventilação mecânica. Isso significa que essa abordagem é ideal para prever com antecedência pacientes de alto risco e um número mínimo de equipamentos de ventilação e de leitos críticos.

https://doi.org/10.1590/0100-3984.2022.0049

Preoperative evaluation of prostate cancer by 68Ga-PMSA positron emission tomography/computed tomography: comparison with magnetic resonance imaging and with histopathological findings
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Stasiak, Camila Edith Stachera

; Cardillo, Athos

; Almeida, Sergio Altino de

; Rodrigues, Rosana Souza

; Castro, Paulo Henrique Rosado de

; Parente, Daniella Braz

Radiologia Brasileira

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2023, Volume 56 Nº 4 Páginas 171 - 178

Resumo: En Pt | Texto: En Pt | PDF: En | PDF: Pt

Abstract Objective: To evaluate the accuracy of preoperative positron emission tomography/computed tomography with 68Ga-labeled prostate-specific membrane antigen (68Ga-PSMA PET/CT) for staging prostate cancer and compare it with magnetic resonance imaging (MRI) using histopathology of surgical specimens as the gold standard. Materials and Methods: In this retrospective study, 65 patients with prostate cancer were analyzed. Results: The accuracy of 68Ga-PSMA PET/CT for tumor detection was 95%, and that of MRI was 91%. There was no difference between 68Ga-PSMA PET/CT and MRI regarding localization of the lesion. The sensitivity of 68Ga-PSMA PET/CT for detecting extraprostatic extension was quite low (14%). For detection of seminal vesicle invasion, 68Ga-PSMA PET/CT showed a sensitivity of 57% and accuracy of 91%. There was a moderate correlation between the maximum standardized uptake value (SUVmax) and the serum level of prostate-specific antigen (p < 0.01; ρ = 0.368) and between the SUVmax and the International Society of Urological Pathology (ISUP) grade (p < 0.01; ρ = 0.513). Conclusion: 68Ga-PSMA PET/CT is a promising tool for detecting and evaluating the primary tumor, which can alter the staging and management of the disease.

Resumo Objetivo: Avaliar a acurácia da tomografia por emissão de pósitrons/tomografia computadorizada com PSMA (PET-PMSA) pré-operatória para estadiamento do câncer de próstata e compará-la com a ressonância magnética (RM) utilizando o histopatológico cirúrgico como padrão ouro. Materiais e Métodos: Neste estudo retrospectivo foram analisados 65 pacientes com câncer de próstata. Resultados: A acurácia da PET-PSMA para a detecção tumoral foi de 95% e a da RM foi de 91%. Não houve diferença entre a PET-PSMA e a RM quanto à localização da lesão. A PET-PSMA apresentou baixa sensibilidade (14%) para detecção de extensão extraprostática em comparação ao histopatológico. Para detecção de invasão de vesícula seminal, a PET-PSMA apresentou sensibilidade de 57% e acurácia de 91% em comparação ao histopatológico. Houve correlação moderada entre o SUVmax e o PSA (p < 0,01; ρ = 0,368) e entre o SUVmax e o ISUP (p < 0,01; ρ = 0,513). Conclusão: A PET-PSMA é uma ferramenta promissora para detecção e avaliação do tumor primário, alterando o estadiamento e a conduta do paciente.

https://doi.org/10.1590/0100-3984.2022.0122-en

Competência em Informação, Escrita Científica e Educação do Cientista
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Rodrigues, Rosana Ferrareto Lourenço

Perspectivas em Ciência da Informação

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Abr 2022, Volume 27 Nº 2 Páginas 221 - 241

Resumo: Pt En | Texto: Pt En | PDF: Pt | PDF: En

RESUMO A educação científica faz avançar o conhecimento enquanto promove a formação do ser humano. É um processo complexo e dinâmico, que demanda desenvolvimento integrado e interdisciplinar de habilidades e competências, pautado em valores, sentimentos e atitudes. Este é um relato de experiências de um laboratório extensionista de letramento técnico-científico, de um grupo de pesquisas em comunicação científica, em um Instituto Federal. A partir da articulação do trabalho de uma linguista cognitivista, de uma bibliotecária e de um cientista da computação, são desenvolvidas atividades pedagógicas e produzido material didático tecnológico para as aulas regulares e para cursos de extensão presenciais e online, fundamentados em um modelo conceptual que mescla a competência em informação e a escrita científica como processo de aprendizagem, e orienta a elaboração da pesquisa científica e a escrita de textos acadêmicos.

ABSTRACT Scientific education provides the world with knowledge advancement while promoting human education. It is a complex and dynamic process that demands integrated and interdisciplinary development of skills and competences, based on values, feelings and attitudes. We report here the experiences of a technical-scientific literacy laboratory, in a research group in scientific communication, at a Federal Institute. By articulating the work of a cognitive linguist, a librarian and a computer scientist, pedagogical activities are developed and technological teaching material is produced for regular classes and for on-site and online extension courses, based on a conceptual model that blends information literacy and scientific writing as a learning process, and thus guides the development of scientific research and the writing of academic texts.

https://doi.org/10.1590/1981-5344/40005

Takayasu’s arteritis with pulmonary artery involvement
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Silva, Marina de Moraes Carvalho da

; Rodrigues, Rosana Souza

; Marchiori, Edson

Jornal Brasileiro de Pneumologia

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2022, Volume 48 Nº 5 elocation e20220266

Resumo: Pt En | Texto: Pt En | PDF: Pt | PDF: En

https://doi.org/10.36416/1806-3756/e20220266

Pulmonary and cerebral paracoccidioidomycosis
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Machado, Matheus Garcia Lago

; Rodrigues, Rosana Souza

; Marchiori, Edson

Revista da Sociedade Brasileira de Medicina Tropical

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2022, Volume 55 elocation e0188-2022

Resumo: En | Texto: En | PDF: En

https://doi.org/10.1590/0037-8682-0188-2022

Neurofibromatosis type 1: evaluation by chest computed tomography
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Alves Júnior, Sérgio Ferreira

; Irion, Klaus Loureiro

; Melo, Alessandro Severo Alves de

; Meirelles, Gustavo de Souza Portes

; Rodrigues, Rosana Souza

; Souza Jr., Arthur Soares

; Hochhegger, Bruno

; Zanetti, Gláucia

; Marchiori, Edson

Radiologia Brasileira

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Dez 2021, Volume 54 Nº 6 Páginas 375 - 380

Resumo: En Pt | Texto: En Pt | PDF: En | PDF: Pt

Abstract Objective: The aim of this study was to evaluate chest computed tomography (CT) findings in patients diagnosed with neurofibromatosis type 1 (NF1). Material and Methods: This was a retrospective study in which we reviewed the chest CT scans of 14 patients diagnosed with NF1 and neurofibromatosis-associated diffuse lung disease (NF-DLD). The sample comprised eight women and six men. The median age was 55 years (range, 11-75 years). The diagnosis of NF1 was made on the basis of the diagnostic criteria established by the U.S. National Institutes of Health. The images were analyzed by two chest radiologists, who reached decisions by consensus. Results: The predominant CT finding of NF-DLD was multiple cysts, which were observed in 13 patients (92.9%), followed by emphysema, in eight (57.1%) and subpleural bullae, in six (42.9%). Other findings included subcutaneous neurofibromas, in 12 patients (85.7%), ground-glass opacities, in one (7.1%), and tracheobronchial neurofibromas, in one (7.1%). The pulmonary abnormalities were bilateral in 12 cases (85.7%). The abnormalities were predominantly in the upper lung fields in eight cases (57.1%), and their distribution was random in 11 (78.6%). Conclusion: Pulmonary cysts, emphysema, and subpleural bullae appear to be the chest CT findings that are most characteristic of NF-DLD.

Resumo Objetivo: O objetivo deste estudo foi avaliar os achados pulmonares na tomografia computadorizada do tórax de pacientes diagnosticados com neurofibromatose tipo 1 (NF1). Materiais e Métodos Foram revisados, retrospectivamente, os achados tomográficos de 14 pacientes com doença pulmonar difusa associada à NF1 (NF-DPD). A amostra incluiu oito mulheres e seis homens, com idade entre 11 e 75 anos (mediana de idade de 55 anos). O diagnóstico foi estabelecido com base em critérios diagnósticos predeterminados pelo National Institutes of Health dos Estados Unidos. As imagens foram analisadas de forma independente por dois radiologistas, que chegaram a um consenso. Resultados: Os achados tomográficos predominantes foram múltiplos cistos em 13 pacientes (92,9%), enfisema em oito (57,1%) e bolhas subpleurais em seis (42,9%). Achados associados incluíram neurofibromas cutâneos e subcutâneos em 12 pacientes (85,7%), opacidades em vidro fosco em um (7,1%) e neurofibromas traqueobrônquicos em um (7,1%). As anormalidades pulmonares foram bilaterais em 12 casos (85,7%). Houve predomínio nos terços superiores em oito (57,1%) pacientes e se distribuíram randomicamente pelos pulmões em 11 (78,6%). Conclusão: Os achados tomográficos pulmonares mais frequentes na NF-DPD foram os cistos pulmonares, o enfisema e as bolhas subpleurais.

https://doi.org/10.1590/0100-3984.2020.0150

Tomographic findings in bronchial atresia
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Puglia, Elazir Barbosa Mota Di

; Rodrigues, Rosana Souza

; Daltro, Pedro Augusto

; Souza Jr., Arthur Soares

; Paschoal, Marilene Monteiro

; Labrunie, Ester Moraes

; Irion, Klaus Loureiro

; Hochhegger, Bruno

; Zanetti, Gláucia

; Marchiori, Edson

Radiologia Brasileira

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Fev 2021, Volume 54 Nº 1 Páginas 9 - 14

Resumo: Pt En | Texto: Pt En | PDF: Pt | PDF: En

Resumo Objetivo: Analisar os achados na tomografia computadorizada (TC) de tórax de 23 pacientes com atresia brônquica. Materiais e Métodos: As imagens de TC foram avaliadas por dois observadores e os casos discordantes foram resolvidos por consenso. Os critérios de inclusão foram a presença de anormalidades na TC compatíveis com atresia brônquica e/ou diagnóstico confirmado por exame anatomopatológico das peças cirúrgicas para os pacientes submetidos a ressecção cirúrgica. As TCs foram avaliadas quanto aos principais achados de imagem, à distribuição das lesões, ao envolvimento pulmonar unilateral ou bilateral. Resultados: Os principais achados na TC foram a presença de broncocele, hiperinsuflação do parênquima pulmonar ou ambos. A combinação desses achados foi encontrada em todos os pacientes. Em relação à distribuição, o envolvimento foi unilateral nos 23 casos. Quando se consideraram os lobos mais acometidos, o lobo superior esquerdo foi o mais acometido, seguido do lobo inferior direito, lobo superior direito, lobo médio e lobo inferior esquerdo. Conclusão: O diagnóstico de atresia brônquica pode ser feito em presença de broncocele associada com hiperinsuflação do parênquima pulmonar adjacente.

Abstract Objective: To evaluate computed tomography (CT) findings in 23 patients with bronchial atresia. Materials and Methods: The CT images were reviewed by two radiologists who reached decisions by consensus. We included only patients who presented with abnormalities on CT and in whom the diagnosis had been confirmed by pathological examination of the surgical specimen (if the lesion was resected). The CT scans were assessed in order to identify the main findings and to map the distribution of the lesions (i.e., to determine whether the pulmonary involvement was unilateral or bilateral). Results: The main CT finding was the combination of bronchocele and hyperinflation of the distal lung. That combination was observed in all of the patients. The lesions were unilateral in all 23 cases, being seen predominantly in the left upper lobe, followed by the right lower lobe, right upper lobe, middle lobe, and left lower lobe. Conclusion: The diagnosis of bronchial atresia can be reliably made on the basis of a finding of bronchocele accompanied by hyperinflation of the adjacent lung parenchyma.

https://doi.org/10.1590/0100-3984.2019.0136 760 downloads

Involvement of bone in disseminated paracoccidioidomycosis
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Martins, Philippe Alcântara Gonçalves

; Rodrigues, Rosana Souza

; Barreto, Miriam Menna

Revista da Sociedade Brasileira de Medicina Tropical

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2021, Volume 54 elocation e0620-2020

Resumo: En | Texto: En | PDF: En

https://doi.org/10.1590/0037-8682-0620-2020 188 downloads

10.

Consensus statement on thoracic radiology terminology in Portuguese used in Brazil and in Portugal
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Hochhegger, Bruno

; Marchiori, Edson

; Rodrigues, Rosana

; Mançano, Alexandre

; Jasinowodolinski, Dany

; Chate, Rodrigo Caruso

; Souza Jr, Arthur Soares

; Silva, Alexandre Marchini

; Sawamura, Márcio

; Furnari, Marcelo

; Araujo-Neto, Cesar

; Escuissato, Dante

; Pinetti, Rogerio

; Nobre, Luiz Felipe

; Warszawiak, Danny

; Szarf, Gilberto

; Telles, Gustavo Borges da Silva

; Meirelles, Gustavo

; Santana, Pablo Rydz

; Antunes, Viviane

; Capobianco, Julia

; Missrie, Israel

; Souza, Luciana Volpon Soares

; Santos, Marcel Koenigkam

; Irion, Klaus

; Duarte, Isabel

; Santos, Rosana

; Pinto, Erique

; Penha, Diana

Jornal Brasileiro de Pneumologia

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2021, Volume 47 Nº 5 elocation e20200595

Resumo: Pt En | Texto: Pt En | PDF: Pt | PDF: En

RESUMO A comunicação eficiente entre a equipe médica é um fator importante no diagnóstico e tratamento precoce e adequado dos pacientes. A terminologia utilizada em relatórios de exames radiológicos aparece nesse contexto como um elo importante entre radiologistas e os demais integrantes da equipe médica. Portanto, a heterogeneidade no uso de termos em relatórios é importante mas ainda pouco discutida. Este artigo é resultado de uma extensa revisão da nomenclatura radiológica em radiologia torácica, englobando pela primeira vez termos utilizados em vários métodos (radiografia, TC e RM), desenvolvida por radiologistas brasileiros e portugueses. O objetivo desta revisão da terminologia médica foi criar uma linguagem padronizada para os profissionais médicos e as equipes multidisciplinares.

ABSTRACT Effective communication among members of medical teams is an important factor for early and appropriate diagnosis. The terminology used in radiology reports appears in this context as an important link between radiologists and other members of the medical team. Therefore, heterogeneity in the use of terms in reports is an important but little discussed issue. This article is the result of an extensive review of nomenclature in thoracic radiology, including for the first time terms used in X-rays, CT, and MRI, conducted by radiologists from Brazil and Portugal. The objective of this review of medical terminology was to create a standardized language for medical professionals and multidisciplinary teams.

https://doi.org/10.36416/1806-3756/e20200595 181 downloads

11.

Chest computed tomography to evaluate lymphocytic interstitial pneumonia
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Barreto, Miriam Menna

; Rodrigues, Rosana Souza

Radiologia Brasileira

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Out 2020, Volume 53 Nº 5 Páginas V - VI

Resumo: Pt En | Texto: Pt En | PDF: Pt | PDF: En

https://doi.org/10.1590/0100-3984.2020.53.5e1 604 downloads

12.

Computed tomography findings in a Brazilian cohort of 48 patients with pneumonia due to coronavirus disease
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Werberich, Gabriel Madeira

; Marchiori, Edson

; Barreto, Miriam Menna

; Rodrigues, Rosana Souza

Revista da Sociedade Brasileira de Medicina Tropical

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2020, Volume 53 elocation e20200405

Resumo: En | Texto: En | PDF: En

Abstract INTRODUCTION: This study was conducted to retrospectively review chest computed tomography (CT) findings in a Brazilian cohort of patients with pneumonia caused by the severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2). METHODS: Chest CT scans of 78 patients with confirmed coronavirus disease (COVID-19), obtained in March and April 2020, were reviewed. Of 78 cases, the CT scans of 48 (61.5%) showed lung opacities. CT opacity features, their distribution, and the extent of infiltration were evaluated. RESULTS: The most common CT findings were ground-glass opacities (97.9%), crazy-paving pattern (58.3%), and mixed pattern (18.8%). Rounded lung opacities were observed most frequently (70.8%). Other findings were cystic airspace changes (37.5%), vascular dilatation (35.4%), and the organizing pneumonia pattern (14.6%). The findings were frequently bilateral (87.5%), symmetrical (68.9%), and peripheral (60.2%). CONCLUSIONS: The most common CT findings were ground-glass opacities and the crazy-paving pattern. Involvement was mostly bilateral, symmetrical, and peripheral. Round opacity morphology was frequently observed and might have some degree of specificity to viral COVID-19 pneumonia.

https://doi.org/10.1590/0037-8682-0405-2020 1014 downloads

13.

Vertebral cryptococcosis: An uncommon cause of a paravertebral mass
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Biscotto, Igor

; Barreto, Miriam Menna

; Rodrigues, Rosana Souza

; Marchiori, Edson

Revista da Sociedade Brasileira de Medicina Tropical

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2020, Volume 53 elocation e20190353

Resumo: En | Texto: En | PDF: En

https://doi.org/10.1590/0037-8682-0353-2019 285 downloads

14.

Resistance to Pratylenchus brachyurus in Vitis species population through multivariate approaches and mixed models
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Santos, Paulo Ricardo dos

; Viana, Alexandre Pio

; Gomes, Vicente Martins

; Preisigke, Sandra da Costa

; Almeida, Odimar Ferreira de

; Santos, Eileen Azevedo

; Rodrigues, Daniele Lima

; Rodrigues, Rosana

; Walker, Michael Andrew

Scientia Agricola

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Out 2019, Volume 76 Nº 5 Páginas 424 - 433

Resumo: En | Texto: En | PDF: En

ABSTRACT: Genetically diverse interspecific hybrids of Vitis were selected for resistance to Pratylenchus brachyurus. Three segregating populations with 57 hybrid crosses were evaluated. The parents included Vitis romanetiiC166-043 × 07355-075, 06354-047 × Cereza and 06354-047 × Nocera, selected from the germplasm bank at the University of California, Davis, the United States. The experiment was arranged in a randomized block design, with three replications and three plants per plot. Root mass, nematodes per gram of root and reproduction factor were determined and used as quantitative variables; 16 multi categoric descriptors were also evaluated. The traits were analyzed using the Ward-Modified Location Model procedure (Ward-MLM) for the composition of genotype groups. Genetic parameters and prediction of genetic values by Restricted Maximum Likelihood / Best Linear Unbiased Prediction (REML / BLUP) were assessed. The Ward-MLM classification strategy supported the formation of three homogeneous groups. Group I comprised 13 hybrids; Group II, 26 hybrids; and Group III, 18 hybrids. Groups II and III contained hybrids resistant to P. brachyurus. High broad sense heritability values were found for root mass, reproduction factor and nematodes per gram of root, which provided genetic gain and allowed selection of resistant genotypes available for cloning, since the total genetic variance occurred due to the dominance effects. Of the 57 genotypes assessed, those with the lowest genotypic values for reproduction factor were selected as resistant, including: CH3.2, CH3.23, CH3.8, CH3.37, CH3.38, CH3.41, CH3.36, CH2.1, CH2.7, CH1.1, CH1.3 and CH1.2.

https://doi.org/10.1590/1678-992x-2017-0387 1088 downloads

15.

Microsatellites for detecting inconsistencies in Capsicum cultivars registration in Brazilian database: more than meets the eye
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Jul 2019, Volume 37 Nº 3 Páginas 285 - 293

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RESUMO No Brasil, o registro de cultivares é feito com cadastramento no Registro Nacional de Cultivares (RNC), o qual, além de habilitar a comercialização do material propagativo da cultivar, garante ao produtor pureza e identidade genética dos propágulos. Mas, é possível que as informações fornecidas para o registro e comercialização das cultivares estejam imprecisas. Este trabalho relata o uso de marcadores microssatélites na detecção de inconsistências nos dados de cultivares de Capsicum spp. no banco de dados oficial (CultivarWeb). Sete cultivares foram avaliadas, sendo três em análise de identidade genética (Amarela Comprida, De Cayenne e Cayenne Long Slin) e as demais foram referência para as espécies C. annuum, C. frutescens e C. chinense. Trinta e três locos microssatélites foram polimórficos e apresentaram 76 alelos (média de 2,3 alelos/loco). O Índice de Fixação (F) apontou alta homozigose e os estimadores de diversidade genética (Ho e I) revelaram baixa diversidade genética entre as cultivares. A análise molecular, representada no dendrograma e no gráfico da Análise de Coordenadas Principais (PCOA), mostrou que as cultivares investigadas são da espécie C. annuum, ao contrário do que consta registrado no CultivarWeb, que informa a espécie das referidas cultivares como C. frutescens. Recomenda-se, portanto, que a checagem dos dados inseridos no CultivarWeb seja aprimorada.

ABSTRACT In Brazil, cultivars are registered by National Register of Cultivars (RNC), which besides enabling commercialization of cultivar propagative material, also guarantees the producers genetic purity and identity of propagules. However, it is possible that the information about registration and commercialization of some cultivars is inaccurate. This study aims to analyze the use of microsatellite markers to detect inconsistencies in data of Capsicum spp. cultivars obtained from the official database (CultivarWeb). Seven cultivars were evaluated, three of them were through genetic identity analysis (Amarela Comprida, De Cayenne and Cayenne Long Slin) and the others were used as standard for the species C. annuum, C. frutescens and C. chinense. Thirty-three microsatellite loci were polymorphic and presented 76 alleles (an average of 2.3 alleles/locus). Fixation Index (F) showed high homozygosis and estimators of genetic diversity (Ho and I) presented low genetic diversity among cultivars. The molecular analysis, represented in a dendrogram and in Principal Coordinate Analysis Chart (PCOA), showed that the investigated cultivars belong to C. annuum, contrary to what is registered in CultivarWeb, which indicates that such cultivars belong to the species C. frutescens. Thus, the authors recommend that the data in the CultivarWeb should be checked and enhanced.

https://doi.org/10.1590/s0102-053620190306 565 downloads

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